Scully et le directeur adjoint Walter Skinner recherchent Mulder, disparu à Bellefleur. Le nouveau directeur du FBI, Alvin Kersh, nomme alors comme chef de commission d’enquête l’agent John Doggett afin de retrouver Mulder et de surveiller Scully et Skinner. Gibson Praise, le chaînon manquant de l’hybridation extraterrestre, semble devenir l’objet de toutes les convoitises puisqu’il est recherché par le tueur à gages extraterrestre et par le FBI…
