I denne film møder vi Khumba, der er en ung zebra, som kun er født med halvdelen af sine striber på kroppen. Khumba bliver udstødt af sin overtroiske flok der beskylder ham for at være årsagen til den tørke der på mystisk vis har ramt landet. Khumba begiver sig, sammen med en kæk gnu og en struds, ud på en misson, hen over ørkenen Karoo, for at finde et legendarisk vandhul, hvor de første zebraer fik deres striber. Men før Khumba kan blive genforenet med sin flok må han først stå ansigt til ansigt med leoparden Phango i det store opgør på savannen...
