Der er gået 5 år efter begivenhederne i den første film, og byens klodsede indbyggere står nu overfor en DUPLO-invasion fra det ydre rum. Emmet må nu i selskab med Lucy, Batman og deres andre venner begive sig ud på en farefuld rejse til fjerne galakser for at overvinde invasionen og genoprette freden i universet.
